Dentro de las funciones de la Dirección de Planeación e Instrumentación están las siguientes:

• Coordina procesos de planeación como la formulación de los Planes de Desarrollo.
• Coordina el proceso de formulación y validación de los POA de todas las dependencias de la Universidad.
• Coordina el análisis de prefactibilidad y pertinencia de la Nueva Oferta Educativa.
• Coordina la formulación de las propuestas de los diferentes fondos extraordinarios como PROEXEES, PADES e Inclusión.
• Brinda asesoría y acompañamiento en la formulación de distintos proyectos para obtener recursos.
• Coordina las actividades de la COD-COEPES.
• Gestiona la validación de las transferencias de recursos ante Secretaría de Planeación y Secretaría de Hacienda.
• Participa en el análisis de la organización académica y administrativa.
• Participa la formulación de manuales de organización, funciones y puestos.